國藥健字號和國藥準字號所代表的產品不同。國藥健字牌是指的保健品，不具備治療疾病的作用；國藥準字號是指是藥品，具有治療疾病的作用。國藥健字牌和國藥準字號產品效果不同。國藥健字牌保健品是用於調節機體機能，提高人體抵禦疾病的能力，改善亞健康狀態，降低疾病發生的風險，不以預防、治療疾病爲目的。國藥準字號藥品是指用於預防、治療、診斷人的疾病，有目的地調節人的生理機能並規定有適應症或者功能主治、用法和用量的物質。國藥健字牌和國藥準字號產品審批機構不同。國藥準字號是指是國家藥監局批准的，准予生產的藥品。國食健字是國家食品藥品監督局批准的准予生產的保健品。