註冊會計師審計過程有三個階段。分別是：第一階段：計劃階段，第二階段：實施階段，第三階段：完成階段。第一階段：計劃階段（一）初步評價被審計單位的內部控制系統（二）分析審計風險（三）編制審計計劃第二階段：實施階段（一）進駐被審計單位（二）進一步檢查和評價內部控制系統（三）審查會計報表及其所反映的經濟活動（四）收集審計證據第三階段：完成階段（一）全面評估錯報風險，整理、評價審計證據（二）複覈審計工作底稿（三）形成審計結論，出具審計報告。
