牙刷架跟其他的一樣，也是要清潔的，但牙刷架縫隙比較多，清潔起來有點複雜。但只要掌握了方法技巧，也是很容易的，下面是一些小技巧。首先，取出牙刷架中的牙刷，用水沾溼舊牙刷，清除縫隙裏的污垢。接着，有一些難去除的污物時，用少量的液體肥皂清除；如果有污漬出來的時候就用衛生紙擦拭。最後，底部用溼的清潔布擦拭，等其完全乾燥後，將牙刷放入牙刷架中。
