1、入學考試不同。函授專升本都必須要通過成人高中教育，在拿到相關的畢業證書以後還需要被學校的繼續教育學院所錄取，入學方面有一定的要求。自考本科沒有入學考試的要求，考生完全是自力更新，直接學習。
2、學習時間不同。函授專升本必須要在3年的時間裏面完成學習，不可以小於三年。自考則沒有相關的時間規定。
3、費用不同。函授專升本和平常的全日制教育繳費模式差不多，都是按照年費收取的，而自考本科則是考一科，收取一科的費用。
4、學習方法不同。函授專升本多數以面授的形式出現，必須要學校組織學習和考試。自考的話是完全通過個人努力來完成學業的。
5、畢業形式不同。函授專升本畢業以後可以得到成人教育畢業證書，可以直接申請學歷證書。而自考本科則需要在完成專業規定的課程後，方可遞交學歷證書的申請證明。
