水銀體溫計測量的部位主要有：腋下、口腔、直腸。無論哪一種測量部位，使用前都應先將體溫計的水銀汞柱甩到35℃以下。
1.腋下測溫：使用水銀體溫計要將體溫計水銀端放在腋窩深處，用上臂將體溫計夾緊，以免脫位或掉落，測量5-10分鐘，取出體溫計，讀取溫度數據後，用衛生紙擦拭體溫計，以便下次或他人使用。
2.口腔測溫：口腔溫度的採集是藉由病患將溫度計正確且安全的放置到口腔的能力。也就是排除了小孩或是無力抵抗咳嗽、虛弱的人或是會嘔吐的人。需要3-5分鐘。
3.直腸測溫：在直腸溫度的量測時，特別是由另一人來量測時，應該要使用潤滑劑來幫助。雖然直腸溫度最爲準確，但是要考量這樣的行爲在某些國家或是文化中是令人難爲情的。另外如果置入溫度計的方式不正確則會讓病人感到不舒服甚至疼痛。嬰兒通常都使用直腸溫度量測，然而還是要藉由護士來操作比較妥當。需要1-3分鐘的時間。
