能源微生物學是在環境保護和環境工程事業蓬勃發展的基礎上應運而生的一門微生物學的新的分支學科，生物工程又稱發酵工程。能源微生物學是講如何利用微生物的生理生態、細胞結構及其功能特性，包括微生物的營養、呼吸、物質代謝、生長、繁殖、遺傳與變異等基礎知識，來進行城市生活污水、工業廢水和城市有機固體廢棄物等的生物處理和廢棄生物處理的學科。
