內部審計主要審查公司內部的經營管理、風險控制能力、內部治理情況等，如公司內部的採購流程、生產流程、銷售流程、人事部績效管理、財務管理、物流管理等，以及進行舞弊調查，接受舉報投訴。內部審計會對公司某一部門的工作效率和效益進行分析，訪談部門的相關人員，對財務數據進行測試，然後發現公司管理過程中存在的問題，對業務員的銷售訂單進行檢查，測試訂單的真實性情況，挖掘銷售部門的市場管理過程中存在的問題。內部審計是公司獨立的部門，直接對公司董事會負責，由總裁或副總裁直接管理；大部分內部審計部門都可以針對審計發現的問題對被審計單位的管理人員和違規責任人提出處罰建議，甚至直接做出處罰決定，遇到重大經濟案件會和公司的法務部門進行聯合稽查，提交當地公安機關處理。
