微生物，是指一切肉眼看不到或看不清楚，因而需要藉助顯微鏡觀察的微小生物，包括細菌、病毒、真菌以及一些小型的原生動物等在內的一大類生物羣體。它個體微小，與人類生活密切相關，涵蓋了有益有害的衆多種類，廣泛涉及健康、食品、醫藥、工農業、環保等諸多領域。在中國大陸地區的教科書中，把微生物劃分爲以下8大類：細菌、病毒、真菌、放線菌、立克次體、支原體、衣原體、螺旋體。
9世紀末和20世紀初，微生物學被牢固地建立起來。其後，它的主要發展有兩個方面：一是研究傳染病和免疫學，研究疾病的防治和化學治療劑的功效；另一方面是和遺傳學的結合。
