慧根深厚意思是很有智慧。佛家說的慧根爲二十二根之一，五根之一，意思是智慧、悟性。慧根一詞來源於梵語prajn~a^-indriya，巴利語pan~n~indriya的翻譯。觀達真理，稱爲慧；智慧具有照破一切、生出善法之能力，可成就一切功德，以至成道，故稱慧根。
大乘義章卷四（大四四·五五五下）：‘言信根者，於境決定，名之爲信；信能生道，故名信根。（中略）言慧根者，於法觀達，目之爲慧，根同前釋。’[雜阿含經卷二十六、俱舍論卷二]
慧根其實就是悟性，是靈性。心爲萬法源，心經就是爲心源而說，所以叫心經，心經的智慧，爲大智慧，妙智慧，智慧功能來源於心，心爲智慧體，心爲智慧根，稱慧根。
這裏的“慧”，不是說世間的普通“智慧”之義，而是指衆生對於佛法真諦之“佛慧”，有過去累劫的積聚影響力和現在宿世的靈通領悟力；這裏的“根”，是“根器”之義，即衆生對“佛慧”的根基深淺水平。
