含氟廢水處理運用以下化學原理：1、生成難溶氟化物沉澱：生成難溶氟化物沉澱就是利用鈣鹽將氟離子轉化爲難溶的氟化鈣沉澱。聯合使用鈣鹽與鎂鹽、鋁鹽或磷酸鹽後可提高除氟效果使出水的殘餘氟離子濃度更低，主要原因是形成了新的更難溶的含氟化合物；2、離子或配位體交換：氟離子羥基半徑及電荷都較爲相近，除氟劑中的羥基基團可與氟離子交換而達到除氟的目的；3、化學吸附：吸附劑之所以具有良好的吸附特性主要是由於它的密集的細孔結構和巨大的比表面積或具有可以與吸附質分子形成化學鍵。
