1、骨關節發育不全
這是薩摩耶犬多發的骨關節疾病。當薩摩耶犬股關節發育不全的時候，因髖臼淺，關節不能夠非常好地吻合在一起，又因爲大腿骨骨頭的形狀歪曲，因而不能夠完全咬合。當咬合進一步惡化的時候，關節完全脫落，便可能會出現骨關節脫臼。這種疾病的遺傳性的因素要佔70%，剩下的30%是肥胖負擔重或者是肌肉不發達而引起的。
2、過敏性皮炎
當受到黴菌，灰塵，滿蟲，化學物質等多種的物質的影響時，會引起薩摩耶犬皮膚髮炎的疾病。患病的薩摩耶犬頻繁搔撓，劇烈瘙養，偶爾會見啃咬患部。反覆搔撓的部位會脫毛，皮膚會有抓傷，或是皮膚髮黑，增厚。
3、糖尿病
初期尿量異常的增加，因尿量的增加而口渴，多飲。食慾旺盛，體重減輕，但是因初期水腫，不太容易被發現。輕症可以通過食療，運動控制血糖值。犬糧則要換成熱量低，抑制碳水化合物以及脂肪低的品種。
