黑白相間毛色的狗不一定就是邊境牧羊犬。邊境牧羊犬常見的毛色有黑白兩色、藍白兩色和棕白兩色，此外還有以黑、藍、棕爲主色的三色毛，以及藍隕色和紅隕色等。黑白兩色的邊境牧羊犬最爲常見。邊境牧羊犬能抵禦惡劣氣候，被毛有粗毛和短毛兩種類型且皆有柔軟、濃密的雙層毛。在脖頸兩側、臀部、後腿以及尾巴上都有豐滿的粗毛，臉部、耳朵、前肢和後肢的毛髮爲柔順的短毛。
