兩個專業各有各的優勢，無法進行具體比較。
會計專業：屬工商管理學科，是一個應用性較強的專業。本專業設有企業會計、國際會計、註冊會計師等三個專業方向。專業以企業會計爲主，兼顧計算機與財務管理。多方位培養學生處理會計業務與管理財務的操作能力和創新能力。本專業培養具備管理、經濟、法律和會計學等方面的知識和能力，能在企、事業單位及政府部門從事會計實務以及教學、科研方面工作的工商管理學科高級專門人才。
工程管理專業：出現在20世紀80年代末期。該學科主要培養具有管理學、經濟學、土木工程技術、計算機管理和外語的綜合知識，能在國內外工程建設領域，從事項目決策和全過程管理的複合型、外向型、開拓型的高級管理人才。學生在校學習期間，要接受工程師和經濟師的基本素質訓練，打好工程技術、管理、經濟、法律、外語及計算機應用方面的基礎。
