細菌可根據形狀分爲三類，即:球菌、桿菌和螺形菌(包括弧菌、螺菌、螺桿菌)。按細菌的生活方式來分類，分爲兩大類:自養菌和異養菌，其中異養菌包括腐生菌和寄生菌。按細菌對氧氣的需求來分類，可分爲需氧(完全需氧和微需氧)和厭氧(不完全厭氧、有氧耐受和完全厭氧)細菌。按細菌生存溫度分類，可分爲喜冷、常溫和喜高溫三類。
