一些細菌只需要二氧化碳作爲它們的碳源，被稱作自養生物。那些通過光合作用從光中獲取能量的，稱爲光合自養生物。那些依靠氧化化合物中獲取能量的，稱爲化能自養生物。另外一些細菌依靠有機物形式的碳作爲碳源，稱爲異養生物。正常生長所需要的營養物質包括氮，硫，磷，維生素和金屬元素，例如鈉，鉀，鈣，鎂，鐵，鋅和鈷。
