1、化學清除法：使用除藻劑，效果普通，優點是對任何藻類都有效，且可有效清除附着在水草、沉木等不易清除地方的藻類，缺點是依據品質不同對魚和生態平衡有一定程度的衝擊。2、生物清除法：使用除藻動物，如：笠螺、白玉飛狐、琵琶鼠、黃金琵琶鼠、黑殼蝦、大和藻蝦來控制藻類的數量，效果爲三種中所花費時間較長，但最安全也最省力的方式。
