一、申請階段。
申請人申請衛生行政許可，應當按照法定的程序和要求向當地衛生行政部門提出申請，可以委託代理人提出申請，但應當提供委託代理證明。申請人應當如實向衛生行政部門提交有關材料，並對其申請材料的真實性負責，承擔相應的法律責任。
二、受理階段。
衛生行政部門接收申請時，要對申請事項是否需要許可、申請材料是否齊全等進行覈對，並根據情況分別作出處理：不受理、當場更正、補正申請材料、受理。衛生行政許可決定作出前，申請人要求撤回申請的，可以撤回。
三、審查階段。
衛生行政部門受理申請後，要對申請人提交的申請材料進行審查。由於不同的法律要求，所以審查申請材料的方式也不同。
四、聽證階段。
需要說明一點，該階段並不是每種衛生許可必經的環節。只有法律規定實施衛生行政許可應當聽證的事項，或者衛生行政部門認爲需要聽證的衛生行政許可事項，衛生行政部門在作出衛生行政許可決定前向社會公告，並舉行聽證。
