天然水晶是在自然條件下形成的，生長在地殼深處，通常都要經歷火山和地震等劇烈的地殼運動才能形成。天然水晶屬於礦產資源，非常稀有和珍貴，屬於寶石之一。多是在地底下、巖洞中，需要有豐富的地下水來源，地下水又多含有飽和的二氧化硅，同時此中的壓力約需在大氣壓力下的二倍至三倍左右，溫度則需在550－600℃間，再給予適當時間，水晶就會依着三方晶系的自然法則，而結晶成六方柱狀的水晶了。
水晶因像純淨的水一樣透明亮潔而得名。有的人以爲水晶是生在水裏的，許多神話故事也把龍王在海底居住的宮殿稱爲“水晶宮”。實際上，天然水晶不是生在水裏，而專是生於山上的巖洞中。水晶晶體是在岩石空洞中長出來的。水晶在成長過程中，一定要有足夠的空間，同時必須以洞壁爲屬依託，因此人們所見到的天然水晶晶體往往是上半截長得很好，而下半截的晶體卻不完整。
