每平方米苗牀土用微生物菌肥200～300克與苗牀土混勻後播種，畝用1～2公斤，與農家肥、化肥或細土混均後溝施、穴施、撒施均可。水稻使用時的基肥、櫱肥、穗肥可代替20%的化肥使用。
有機肥不僅能爲農作物提供全面營養，而且肥效長，可增加和更新土壤有機質，促進微生物繁殖，改善土壤的理化性質和生物活性，是綠色食品生產的主要養分。
無機肥，簡稱化肥。包括氮、磷、鉀、複合肥等。它具有成分單純，含有效成分高，易溶於水，分解快，易被根系吸收等特點，故稱“速效性肥料”。
生物菌肥是以微生物的生命活動導致作物得到特定肥料效應的一種製品，是農業生產中使用肥料的一種。微生物肥料中有益微生物的種類、生命活動是否旺盛是其有效性的基礎，而不像其它肥料是以氮、磷、鉀等主要元素的形式和多少爲基礎。
