法院不會主動查支付寶賬戶，但其中一方可以向法院申請調查支付寶賬戶，如果賬戶中的是共同財產，離婚時應進行分割。根據《婚姻法》第十七條，夫妻在婚姻關係存續期間所得的下列財產，歸夫妻共同所有：
(一)工資、獎金;
(二)生產、經營的收益;
(三)知識產權的收益;
(四)繼承或贈與所得的財產，但本法第十八條第三項規定的除外;
(五)其他應當歸共同所有的財產。
夫妻對共同所有的財產，有平等的處理權。
《婚姻法》第三十九條，離婚時，夫妻的共同財產由雙方協議處理;協議不成時，由人民法院根據財產的具體情況，照顧子女和女方權益的原則判決。
