綠色食品標誌使用期是3年。通過綠色食品認證的產品可以使用統一格式的綠色食品標誌，有效期爲3年，時間從通過認證獲得證書當日算起，期滿後，生產企業必須重新提出認證申請，獲得通過纔可以繼續使用該標誌，同時更改標誌上的編號。
證書有效期滿，需要繼續使用綠色食品標誌的，標誌使用人應當在有效期滿三個月前向省級工作機構書面提出續展申請。省級工作機構應當在四十個工作日內組織完成相關檢查、檢測及材料審覈。初審合格的，由中國綠色食品發展中心在十個工作日內作出是否准予續展的決定。准予續展的，與標誌使用人續簽綠色食品標誌使用合同，頒發新的綠色食品標誌使用證書並公告；不予續展的，書面通知標誌使用人並告知理由。標誌使用人逾期未提出續展申請，或者申請續展未獲通過的，不得繼續使用綠色食品標誌。
