不同類型的疫苗，要求的保存條件是不一樣的。必須按說明書規定的條件保存，才能保證疫苗質量不會顯著下降，一般來說，滅活苗於2～8℃環境中避光保存，不應冷凍保存。活疫苗一般應在-15℃條件下避光保存，對於凍幹弱毒活毒（菌）苗，除了個別的有不同要求之外，一般都要求低溫冷凍保存，保存溫度要穩定，尤其不能反覆凍融。
