軟件不兼容也叫軟件衝突，是指兩個或多個軟件在同時運行時，程序可能出現的衝突，導致其中一個軟件或兩個軟件都不能正常工作。對於軟件衝突在用戶電腦終端上的表現和反應，“有的從安裝開始，有的是在運行中，情況很複雜”“具體表現難說。具體情況都不一樣，不同機器不一樣，同一個機器，不同使用狀態下也不一樣”，“可以肯定的是，有可能出毛病，”比如“電腦運行緩慢，某個軟件不能正常使用，電腦死機等等”。
這種衝突可能是軟件廠商之間缺乏溝通，在程序設計上有互相沖突的地方，也有可能是出於競爭的考慮，故意給對方設置障礙。
如果是前者，那就形成一種無意的軟件衝突；而如果是後者，就構成一種惡意的軟件衝突。事實上，很多軟件衝突都是廠商惡意爲之的。例證 同類軟件，裝多了，最容易產生衝突，兩款相似功能的軟件，最好只裝一款，另一款卸載。
