1、換水，對於水面較小，水源穩定塘口，定期換水是一種行之有效的處理方法，在經濟上可行，操作管理也方便；
2、投加化學藥劑，當已經發生富營養化藍藻暴發引起水體變臭時，可以採用局部用藥的方法直接向藍藻投加化學藥劑，從而消除藻類，一般沿池邊潑灑含氯殺藻劑，或硫酸銅、絡合銅等重金屬鹽，此法有一定效果；
3、控制水體富營養化，採用生物及化學方法，有效降低水體富營養化程度，以達到間接抑制藍藻的繁殖，通常每10天左右，全池潑灑1次枯草芽孢桿菌及腐植酸鈉，同時杜絕生活污水進入池塘，以消除有機磷對水體的影響；
4、生物生態修復法，生態法就是以生態學原理爲指導，將生態系統結構與功能應用於水質淨化。
