需要永久保存的會計檔案有：會計檔案保管清冊、會計檔案銷燬清冊以及年度財務報告、財政總預算、行政單位和事業單位決算、稅收年報、 資本金、股金及股權明細、開銷戶登記簿、客戶掛失申請書、掛失登記簿、補發憑單收據、賬銷案存的清單或資料、機構變動交接清冊、有權機關查詢、凍結及扣劃書、會計系統數據移植日的所有會計檔案、會計初始環境文本、 基礎數據維護修改有關記錄、 文件等。
會計檔案的保管期限爲永久保存和定期保存兩類。永久檔案即長期保管，不可以銷燬的檔案。會計檔案是國家檔案的重要組成部分，也是各單位的重要檔案，它是對一個單位經濟活動的記錄和反映，通過會計檔案，可以瞭解每項經濟業務的來龍去脈；可以檢查一個單位是否遵守財經紀律，在會計資料中有無弄虛作假、違法亂紀等行爲；會計檔案還可以爲國家、單位提供詳盡的經濟資料，爲國家制定宏觀經濟政策及單位制定經營決策提供參考。
