通常體重超過1斤的佛鱷龜可以深水飼養，體重沒有達標的佛鱷龜不能深水飼養，容易出現溺水的情況。其次，深水飼養期間需要佈置休息臺，方便佛鱷龜能換氣，並且深水容易壞水，需要每隔3～5天換一次水。
佛鱷龜可以深水養佛鱷龜可以深水飼養，不過對於體型有一定的要求，小龜最好不要深水飼養，容易出現難以出水面換氣，導致出現溺水的情況。在佛鱷龜的體重達到1斤重時深水飼養，則一般沒啥問題。
但是在剛開始深水飼養佛鱷龜的時候，也需要保證它能夠將頭部伸出水面，否則對佛鱷龜的健康有一定影響。並且深水飼養期間，還需要在龜缸裏面佈置陸地當做休息臺。
不過深水比淺水更容易換水，在飼養期間需要注意定期換水，至少需要每間隔3～5天時間換一次。另外，餵食需要儘量投在佛鱷龜正上方，避免食物落下缸底。
