火車寵物託運是安全的，但必須在兩證(動物免疫證和犬類準養證)齊全情況下可以辦理託運業務，需攜帶兩證和寵物到動物衛生監督所辦理《出縣境動物檢疫合格證明》。《旅客運輸管理規程》關於行李禁帶品的第五十二條第三款規定：動物及妨礙公共衛生(包括有異味)的物品屬於行李禁帶品，所以嚴禁攜帶寵物乘坐公共交通。
