檸檬樹對土壤要求不嚴，土層深厚、疏鬆、含有機質豐富、保溼保肥力強、pH值微酸性土壤爲最好。
種植時，準備一隻有排水孔的大花盆，底部鋪上一層園藝用布減少排出水垢，將選用的泥土、營養土等混合在一起填入花盆一半處，從苗圃中移植出檸檬樹連泥土一塊放入花盆中，避免傷到根部，在周圍加上更多的泥土，按下植物根部的周圍，不要讓植物的根部裸露在空氣中，澆灌上足夠的水，保持土壤溼潤即可。
注意事項如下：
盆栽檸檬樹在春季3月至4月必須翻盆換土，換盆換土時應施底肥。春季結合換盆進行春剪，剪去內膛枝、枯枝敗葉、病蟲害根葉、徒長枝，以利植株掛果。檸檬樹植株開花前和掛果後，要多次追肥，每月施多元素花肥一次，每半月噴花卉營養液一次，保證果實不易脫落，個大色亮。落葉影響檸檬樹結果，爲避免落葉，在日常管理工作中，忌澆水忽多忽少。植株開花後至掛果前，中午氣溫較高，遮陰3個小時，否則影響正常形花，也妨礙植株掛果。
