分子內氫鍵必須具備形成氫鍵的必要條件，還要具有特定的條件，如：形成平面環，環的大小以五或六原子環最穩定，形成的環中沒有任何的扭曲。分子間氫鍵一般粘度較大。例如甘油、磷酸、濃硫酸等多羥基化合物，由於分子間可形成衆多的氫鍵，這些物質通常爲粘稠狀液體。熔點、沸點分子間有氫鍵的物質熔化或氣化時，除了要克服純粹的分子間力外，還必須提高溫度，額外地供應一份能量來破壞分子間的氫鍵，所以這些物質的熔點、沸點比同系列氫化物的熔點、沸點高。分子內生成氫鍵，熔、沸點常降低。
