嶺南通不可以在深圳用，嶺南通與深圳通合作發行“嶺南通·深圳通卡。手持“嶺南通·深圳通的用戶，可在深圳乘坐地鐵和搭乘公交，並可在所有設有嶺南通付款服務的商戶購物消費。這意味着原來的嶺南通並不能直接在深圳使用，須另購“嶺南通·深圳通方可在深圳使用。
