南通西站和南通站並不是一個地方。南通站主要辦理寧啓、滬通、鹽通、通蘇嘉甬及北沿江鐵路始發終到車，還辦理部分寧啓、北沿江鐵路在本地區通過列車。南通西站主要辦理經寧啓線、滬通線和沿海高鐵通道（鹽通、通蘇嘉甬鐵路）的通過列車。同時南通站始發上海和蘇州方向少量列車在本站停靠。項目總用地面積爲12000,一層公交站場停車位爲32個，二層長途及大巴車場停車位爲32個。
