南京有紫金山、牛首山、幕府山、棲霞山、湯山、青龍山、黃龍山、方山、祖堂山、雲臺山、老山、靈巖山、茅山等，另有富貴山、九華山、北極閣山、清涼山、獅子山、雞籠山等聚散於市內，形成了山多水多丘陵多的地貌特徵。南京城區起伏不平。紫金山中支的餘脈向西延伸，在太平門旁爲富貴山，進城爲小九華山、北極閣，繼續向西連接古長江沖積物堆成的下蜀黃土崗地，把南京城一分爲二，形成了秦淮河水系和金川河水系的天然分水嶺。在城北鏽球公園附近還有獅子山（又名盧龍山），城西有馬鞍山，城南有石子崗（又名瑪瑙崗、聚寶山）。
