1、注意溫度和明火：純過氧乙酸極不穩定，在-20℃時就會發生猛烈爆炸，如遇明火或高溫易發生自燃、燃燒或爆炸。
2、應急處理：一旦有過氧乙酸消毒液濺到皮膚上或眼睛裏，應當立即用流動的清水沖洗，以免造成燒傷。
3、不可用於地面消毒：過氧乙酸對大理石和水磨石等材料地面有明顯損壞作用，切忌用其水溶液擦拭地面。
4、防止腐蝕和損傷：使用過氧乙酸時應防止損壞物品，不得用於精密儀器和鋒利的器械消毒，擦拭消毒後立即用水擦洗乾淨。生產操作者要採取防護措施，如防護眼鏡、防護手套、防護鞋等，以防止沾染到皮膚上造成損傷。
5、確保使用濃度：過氧乙酸不穩定，配製時要保證濃度，隨時使用隨時配製，防止過期使用。應嚴格按照所購入的過氧乙酸消毒液的濃度和使用說明進行調製，在不知確切濃度時，使用前應用消定法或專用試紙測試濃度。不能過高，也不能過低。
