蛋白質二級結構的主要形式包括α-螺旋、β-摺疊、β-轉角和無規捲曲。由於蛋白質的分子量較大，因此，一個蛋白質分子的不同肽段可含有不同形式的二級結構。蛋白質分子的二級結構(secondarystructure)通常是指蛋白質多肽鏈沿主鏈骨架方向的空間走向、規則性循環式排列，或某一段肽鏈的局部空間結構，即蛋白質的二級結構為肽鏈主鏈或一段肽鏈主鏈骨架原子的相對空間盤繞、摺疊位置，它並不涉及氨基酸殘基側鏈的構象。
