1、繁殖方式不同：蟒蛇是卵生的，是將蛋產下後進行孵化，每次產卵數8-103枚，卵為白色，孵化55-61天即破殼。而水蚰是卵胎生的，雌水蟒將受精卵保留在身體內直到孵化，每次可出生10-70多隻小水蟒。2、分佈範圍不同：蟒蛇是東南亞地區廣佈的物種，棲居於熱帶、亞熱帶低山叢林中，需要常綠闊葉林或常綠闊葉藤本灌木叢，以及良好的洞穴供休息及隱蔽。而水蚺生活在南美洲熱帶地區河流附近及其他水體中，主要分佈於世界各地的沼澤地區。3、身體長度不同：蟒蛇長度通常在2-3米左右，而水蚺的身體長度可達10米。
