1、原生瑪瑙是由岩漿的殘餘熱液形成的。這種熱液充填在火山岩如玄武岩、流紋岩的空隙中，因空隙的形狀不同，或成瑪瑙球，或成瑪瑙脈。2、經過自然力的作用，原生瑪瑙脫落而出，再經過山洪衝擊，流水搬運，磨成卵石。這就是我們所見到的在礫石層中的雨花瑪瑙石。雨花石以其紋奇、色豔的自然美著稱於世。它的圈狀花紋是二氧化矽膠液圍繞火山岩空隙、空腔，由內壁開始，從外向內多層次逐層沉澱而成。在其生長過程中，常常發生帶色離子和化合物的週期擴散。
